SeqCombGo/data/CO1.clustal.fas

67 lines
4.3 KiB
Text

CLUSTAL 2.1 multiple sequence alignment
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr TACATACTATTTGGTGTTTGATGCGGAATAGTTGGTACTGGTTTGAGATT
Bradybaena_circulus_circulus TATATATTATTTGGTGTTTGGTGTGGGATAGTTGGTACAGGTTTAAGATT
Bradybaena_virgo_virgo ---------------GTGTGGTGCGGTATAGTTGGCACAGGTTTAAGGTT
** ** ** ** ******** ** ***** ** **
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr ATTAATTCGAATAGAGCTAGGAAGCTCAGGCGTGGTAGTTGAGGAACATT
Bradybaena_circulus_circulus ATTGATTCGAATAGAGTTAGGTAGTTCTGGTGTTATAGCAGAAGAGCATT
Bradybaena_virgo_virgo GCTGATTCGAATAGAACTAGGTACTGCTGGCGTATTGAGAGATGAGCATT
* *********** **** * * ** ** * ** ** ****
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr TTTTTAATGTTATTGTGACAGCGCATGCATTTGTGATAATTTTCTTTATA
Bradybaena_circulus_circulus TCTACAATGTTATTGTAACAGCTCATGCTTTTGTAATAATTTTTTTTATA
Bradybaena_virgo_virgo TTTATAATGTAATCGTCACCGCCCACGCCTTTGTGATAATTTTTTTTATA
* * ***** ** ** ** ** ** ** ***** ******** ******
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr GTTATACCTATTATAATTGGGGGCTTTGGAAATTGAATAGTACCACTGCT
Bradybaena_circulus_circulus GTTATGCCAATCATGATTGGAGGTTTTGGAAATTGAATAGTACCGTTGTT
Bradybaena_virgo_virgo GTTATACCAATTATGATTGGCGGCTTCGGTAATTGAATAGTGCCATTATT
***** ** ** ** ***** ** ** ** *********** ** * *
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr GATTGGGGCTCCGGACATGAGTTTTCCACGTATAAACAATATAAGGTTTT
Bradybaena_circulus_circulus GATTGGGGCACCCGATATGAGCTTTCCACGTATAAACAATATAAGGTTTT
Bradybaena_virgo_virgo GATTGGAGCTCCAGACATAAGGTTTCCTCGAATGAATAATATAAGTTTTT
****** ** ** ** ** ** ***** ** ** ** ******** ****
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr GATTGTTACCCCCTTCTTTTCTTTTATTAATTAGGAGAAGTTTAGTAGAG
Bradybaena_circulus_circulus GATTGTTACCCCCTTCTTTTCTTCTATTAATTAGAAGTAGTCTAGTAGAA
Bradybaena_virgo_virgo GATTACTACCTCCGTCCTTTGTACTATTAATTAGGAGGAGATTAGTAGAA
**** **** ** ** *** * ********** ** ** *******
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr GGTGGAGCAGGAACTGGGTGAACAGTTTACCCACCCCTAAGGTCTTTGGC
Bradybaena_circulus_circulus GGCGGTGCAGGGACCGGTTGAACAGTGTATCCTCCACTTAGCTCACTTGT
Bradybaena_virgo_virgo GGAGGGGCTGGTACTGGTTGGACGGTTTACCCCCCATTAAGAACACTTAC
** ** ** ** ** ** ** ** ** ** ** ** * ** * *
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr TGGCCATGGAGGAGCATCTGTGGATTTAGCAATTTTCTCCCTTCATTTAG
Bradybaena_circulus_circulus AGGTCATAGGAGAGCTGCCGTAGACTTAGCAATCTTTTCTCTTCATTTGG
Bradybaena_virgo_virgo AGGGCATAGAGGTGCTTCGGTAGACTTGGCTATTTTTTCTTTGCATTTGG
** *** * * ** * ** ** ** ** ** ** ** * ***** *
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr CTGGAATGTCTTCTATTTTAGGTGCGATTAATTTTATTACCACAATCTTC
Bradybaena_circulus_circulus CTGGGATATCATCAATTTTAGGTGCAATCAATTTTATTACAACTATTTTT
Bradybaena_virgo_virgo CAGGTATGTCTTCTATTTTAGGGGCCATTAATTTTATTACTACTATTTTT
* ** ** ** ** ******** ** ** *********** ** ** **
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr AATATACGGGCTCCCGGCATAACAATGGAGCGAGTTAGATTATTTGTGTG
Bradybaena_circulus_circulus AATATACGAGCCCCAGGAATAACTATGGAACGTGTTAGACTGTTTGTTTG
Bradybaena_virgo_virgo AATATACGAGCACCAGGTTTGTCAATAGAACGAGTGAGCTTATTTGTGTG
******** ** ** ** * * ** ** ** ** ** * ***** **
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr GTCAATTTTAGTAACAGTATTTCTTTTATTGTT-----------------
Bradybaena_circulus_circulus ATCTATTTTAGTGACAGTGTTTCTTTTATTACT-----------------
Bradybaena_virgo_virgo GTCAATTCTCATTACGGTTTTTTTACTACTACTTTCATTACCCGTCTTAG
** *** * * ** ** *** * ** * *
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr --------------------------------------------------
Bradybaena_circulus_circulus --------------------------------------------------
Bradybaena_virgo_virgo CGGGGGCTATTACTATATTATTAACTGATCGAAATTTTAATACTTCTTTT
Bradybaena_phaeogramma_phaeogr ----------
Bradybaena_circulus_circulus ----------
Bradybaena_virgo_virgo TTTGATCCCG